Pondok Pesantren Attaufiqiyyah berusaha menanamkan pesan-pesan Islam mengenai pondasi dasar penciptaan manusia sebagaiamana termaktub dalam al-Qur’an surat al Baqoroh ayat 30, saling menjaga, mengayomi, melindungi dan mengasihi sesama makhluk ciptaan Allah.

Niali-nilai dasar tersebut dipraktekkan oleh santri terutama santri tingkat akhir dalam mengayomi dan menjaga stabilitas keseharian adik-adik tingkatnya dalam bentuk organisasi kepengurusan formal, Organisasi Santri Attaufiqiyyah (Osaka).